Portrait des vertus de la Mère Catherine Agnès de Saint-Paul Arnauld

La famille Thomas est premièrement mentionnée vers 1490 avec Gentien Thomas, sous le règne de Charles VIII. Il eut deux fils : Gentien et Denis. Le second Gentien du nom s'établit à Paris pour se former aux finances, et se met au service d'Henry d'Ambray, receveur général des finances à Rouen. En 1589, la ville de Rouen est frappée de plein fouet par les Guerres de religion. Gentien Thomas est envoyer porter les nouvelles des troubles rouennais à Henri III à Blois. En reconnaissance de ces services pendant la Ligue, Henri IV le nomme Maître des Comptes de Normandie en avril 1594. La famille s'établie à Rouen.

En 1599, Gentien Thomas acquit la seigneurie du Fossé près de Forges-les-Eaux. Son fils aîné Gentien lui succède à la charge de Maître des Comptes en 1621, et épouse Madeleine Beuzelin, fille du président à Mortier du Parlement de Rouen et soeur de Jean Beuzelin, conseiller au Parlement de Normandie et seigneur de Bosmelet. Le couple eut quinze enfants, dont neuf survécurent. La seigneurie de Bosmelet entre dans le patrimoine des Thomas du Fossé au XVIII^e siècle avec le petit fils de Gentien et Madeleine, Antoine-Augustin Thomas du Fossé, à la mort des dernières héritières du frère de Madeleine Jean Beuzelin.

La famille Thomas du Fossé se rapproche de Jean Duvergier de Hauranne, abbé de Saint-Cyran et chef de file du mouvement janséniste lors d'un entretien avec Gentien Thomas en 1643. Son épouse Madeleine rencontre également Mère Angélique Arnaud, abbesse de Port-Royal, et le couple change son mode de vie en s'éloignant des mondanités et se convertissant au jansénisme. L'éducation des enfants fut confiées à Port-Royal des Champs. Pierre Thomas du Fossé, cinquième enfant de Magdelaine et Gentien Thomas né en avril 1634, est un mémorialiste de Port-Royal grâce à ses Mémoires rédigée à l'automne 1697. Il passe dix-sept années comme élève à Port-Royal, puis devient maître jusqu'à leur dispersion en 1660. Il côtoie Antoine Le Maistre, Antoine Singlin, Louis-Isaac Le Maistre de Sacy, Sébastien Le Nain de Tillemont, Robert Arnault d'Andilly, et d'autres grands noms du jansénisme.