Déclaration des syndics de Chambéry, du 5 janvier 1588 attestent que du 8 juillet au 26 Novembre 1587, sont décédés de contagion dans la ville de Chambéry et ses faubourgs 1133 personnes, et que par ce moyen ont été infectées 365 maison

Cet ensemble est composé de 146 volumes et dossiers. Chronologiquement très étendu, il se compose de manuscrits remontant jusqu'au XIVe siècle, notamment avec la précieuse Lettre de Louis XIII, roi de France, pour gratifier une pension de 400 livres, le 15 mai 1618 (MSS B 478) ou encore, plus tardif, la Bulle pontificale du pape Clément VI (1291-1352) à un ordre des Carmes, XIVe siècle (MSS A 486). Linguistiquement, cette collection est riche de volumes écrits en français, en italien et en latin, tel que le Tychonis Brahe thesaurus observationum 1563-1595, écrit au XVIIe ou XVIIIe siècle (MSS C 331-1 à 2). Ces deux volumes ont été annotés par Jérôme de Lalande (1732-1807), un astronome français et important contributeur pour les sciences de son temps.

La thématique principale de cette collection est la Savoie, en témoigne de nombreux manuscrits et dossier sur l'histoire locale : Notes sur l'histoire de la Savoie, écrit en 1969 par Henri Ménabréa, (1882-1968) bibliothécaire et historien de la Savoie (MSS B 487) ; ou encore, plus ancien, Des anciens thermes d'Aix en Savoye, écrit en 1788 par le comte François de Mouxy de Loche (1756-1837) officier savoyard, entomologiste, et historien régional (MSS A 532). Dans la continuité de ces personnalités savoyardes, se place un auteur récurrent dans cette collection : Antony Dessaix (1825-1893). Journaliste à Lyon, puis archiviste adjoint à Chambéry, il a fait don de près de 15 manuscrits autographes à la bibliothèque municipale.

D'autres donateurs ont privilégié la bibliothèque municipale pour protéger leur histoire, dont la marquise de Jouffroy d'Abans, qui a fait don de ses archives, Brouillons de lettres, titres et papiers concernant les Familles de Pingon et de Mme la marquise de Jouffroy d'Abans, du XVIIIe-XIXe siècle (MSS C 352), ou encore les Documents et archives du Général de division et sénateur Philibert Mollard (1801-1873), au XIXe siècle (MSS C 474), qui a donné 141 pièces, comptant des remises de médailles, titres, reconnaissances de réussites, ordre de mission, ou encore compte rendu d'activité militaire. Un riche fonds pour l'histoire militaire, de ce proche de Napoléon III, entre l'Empire Français et le Piémont-Sardaigne.